More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3447 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  76.49 
 
 
319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  76.51 
 
 
320 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  54.43 
 
 
326 aa  345  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  46.5 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  44.59 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  44.59 
 
 
320 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  44.59 
 
 
313 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  42.04 
 
 
310 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  41.88 
 
 
314 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  41.02 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  41.14 
 
 
318 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  40.48 
 
 
344 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  41.4 
 
 
355 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  41.31 
 
 
649 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.88 
 
 
345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  41.32 
 
 
353 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  42.99 
 
 
327 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.68 
 
 
310 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  42.99 
 
 
327 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  41.21 
 
 
346 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  41.08 
 
 
322 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.32 
 
 
317 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.57 
 
 
319 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  38.23 
 
 
341 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  39.69 
 
 
312 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  41.04 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  43.87 
 
 
326 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.58 
 
 
352 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  36.28 
 
 
331 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 
319 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.53 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  33.44 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
355 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  35.33 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  34.5 
 
 
340 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  32.91 
 
 
335 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  34.5 
 
 
340 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.5 
 
 
334 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.87 
 
 
334 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  34.8 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  33.23 
 
 
334 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  33.23 
 
 
340 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  33.87 
 
 
334 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  31.95 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
327 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
323 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
331 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  32.59 
 
 
334 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  37.78 
 
 
309 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.5 
 
 
332 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
340 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.56 
 
 
332 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
327 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.45 
 
 
313 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
311 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.53 
 
 
346 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
344 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.38 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28 
 
 
312 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
303 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  31.75 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.96 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
361 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.36 
 
 
310 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.62 
 
 
340 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
318 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
306 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  28.8 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.2 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.99 
 
 
337 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 
337 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
320 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.01 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.43 
 
 
288 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.87 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.73 
 
 
318 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.43 
 
 
288 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 
333 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
311 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.41 
 
 
332 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
341 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
328 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
329 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>