More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0657 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 320 aa  656    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  76.51 
 
 		 321 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  74.68 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  50.95 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  44.51 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  42.5 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  42.5 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  43.22 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 		 353 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  42.22 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  41.27 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.59 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  41.02 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  42.36 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  41.4 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  41.64 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.45 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.31 
 
 		 319 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  41.27 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  40.66 
 
 		 649 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  39.05 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  39.52 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  46.09 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.59 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.46 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.49 
 
 		 353 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  34.07 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  35.22 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  32.92 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.23 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 360 aa  172  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  33.12 
 
 		 354 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.12 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 359 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  33.23 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  34.49 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.7 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  33.86 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.81 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  32.6 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  36.89 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.91 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.6 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.47 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.21 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.12 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.08 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  29.87 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.49 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.52 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  27.24 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  29.11 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  28.88 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.46 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.16 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.76 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  31.03 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.18 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.76 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>