More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1531 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
326 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  55.06 
 
 
319 aa  348  7e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  54.43 
 
 
321 aa  345  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  50.95 
 
 
320 aa  333  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  43.57 
 
 
318 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.11 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  42.31 
 
 
313 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  41.51 
 
 
310 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  41.35 
 
 
322 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.51 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  41.67 
 
 
316 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 
314 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  40.67 
 
 
320 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 
344 aa  238  9e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 
344 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  40.37 
 
 
320 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  40.5 
 
 
337 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 
353 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 
312 aa  235  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  37.81 
 
 
341 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  38.04 
 
 
355 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.38 
 
 
310 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  39.23 
 
 
649 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.39 
 
 
319 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
327 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  44.58 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  38.64 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  43.15 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.39 
 
 
352 aa  208  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
319 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  35.1 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  34.48 
 
 
331 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 
320 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  32.4 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.11 
 
 
353 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  36.07 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
356 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
356 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
355 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  34.71 
 
 
334 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 
309 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.3 
 
 
334 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  31.95 
 
 
340 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  31.71 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.27 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  35.12 
 
 
334 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  33.88 
 
 
334 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
359 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
323 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  30.65 
 
 
335 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 
303 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  30.19 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  34.16 
 
 
334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
340 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  31.82 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.85 
 
 
313 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.12 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.83 
 
 
346 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.48 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.26 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.95 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.63 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
318 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  27.63 
 
 
334 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 
320 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
344 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  28.35 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  28.03 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
303 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 
333 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
295 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
361 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
337 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.47 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
341 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  24.5 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.52 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.61 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  24.48 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.26 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.19 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>