More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1256 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  100 
 
 		 316 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  60.06 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.56 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  61.29 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  57.46 
 
 		 314 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  57.14 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.1 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  54.14 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  54.14 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.82 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  54.19 
 
 		 318 aa  345  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  57.14 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  55.05 
 
 		 327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  56.96 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  55.52 
 
 		 649 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  51.59 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  46.5 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  44.51 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  46.3 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  46.63 
 
 		 346 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  41.82 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  41.35 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  41.69 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  40.52 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  45.6 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  40.43 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.35 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  40.24 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  38.19 
 
 		 355 aa  228  9e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  44.07 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  39.49 
 
 		 353 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  42.02 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  42.02 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  37.86 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  38.51 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  38.51 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.02 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  37.22 
 
 		 360 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  38.26 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  39.75 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.93 
 
 		 356 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  34.52 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  36.98 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.65 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  36.02 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.6 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  34.71 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.87 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  34.73 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  36.01 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 340 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  35.35 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  35.83 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  35.37 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.39 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  35.18 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.41 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  35.41 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  37.71 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  41.08 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  34.87 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  32.99 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  31.92 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  38.62 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.22 
 
 		 305 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  36.33 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.9 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  25.87 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  29.58 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  28.44 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  29.15 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>