More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  66.47 
 
 
332 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  64.55 
 
 
338 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  58.72 
 
 
337 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  60.12 
 
 
328 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  56.02 
 
 
344 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  56.63 
 
 
344 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 
361 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 
361 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  39.81 
 
 
345 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.66 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  36.01 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  33.73 
 
 
332 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.33 
 
 
313 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  35.69 
 
 
346 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 
344 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.23 
 
 
345 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
310 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.44 
 
 
335 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.57 
 
 
334 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.83 
 
 
312 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.88 
 
 
353 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  28.03 
 
 
302 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
363 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
360 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
312 aa  126  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.09 
 
 
310 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 
311 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  28.53 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.7 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
355 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.79 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
310 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.95 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
355 aa  112  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 
314 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.15 
 
 
288 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  30.72 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  29.91 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
327 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.15 
 
 
288 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
310 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  29.08 
 
 
340 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
341 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
322 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
340 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.15 
 
 
288 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  29.38 
 
 
350 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  29.51 
 
 
334 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.13 
 
 
340 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
311 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  29.97 
 
 
340 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
337 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  30.03 
 
 
335 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
342 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.03 
 
 
337 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  29.26 
 
 
316 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
331 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.75 
 
 
337 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  25.77 
 
 
319 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
359 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  26.85 
 
 
320 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
358 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  26.85 
 
 
320 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.38 
 
 
334 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 
307 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  28.76 
 
 
334 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.83 
 
 
317 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.86 
 
 
310 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.86 
 
 
330 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.38 
 
 
334 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
370 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.69 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.3 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  31.75 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.68 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>