More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3076 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  100 
 
 
342 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  36.5 
 
 
364 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  34.87 
 
 
341 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  28.19 
 
 
337 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
360 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
349 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.08 
 
 
313 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 
312 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.6 
 
 
337 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  32.63 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.28 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.1 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.2 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  30.11 
 
 
338 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 
341 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.2 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.77 
 
 
346 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
362 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.88 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
387 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
337 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.3 
 
 
310 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
333 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
334 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.79 
 
 
428 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
344 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
369 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
345 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
311 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
325 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
344 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.79 
 
 
329 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.69 
 
 
349 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  26.06 
 
 
340 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.82 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  26.63 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.44 
 
 
316 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  26.67 
 
 
313 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  41.3 
 
 
325 aa  95.9  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  41.3 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  28.16 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
344 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.61 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.14 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25.92 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  25.94 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
350 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.84 
 
 
353 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 
383 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.7 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 
376 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.95 
 
 
332 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.71 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.43 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  30.28 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 
353 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.13 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.13 
 
 
341 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
385 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.11 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.16 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  27.62 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>