More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4943 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
341 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  35 
 
 
337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
339 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  34.87 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
347 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 
356 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.57 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
359 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.98 
 
 
337 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.25 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
326 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
364 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.34 
 
 
312 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  26.01 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
359 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
359 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
357 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 
349 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
359 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
329 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
345 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
362 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
376 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.63 
 
 
313 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.7 
 
 
351 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.1 
 
 
347 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.37 
 
 
351 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.24 
 
 
351 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
351 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.91 
 
 
341 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.24 
 
 
351 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.24 
 
 
351 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
371 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 
334 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
351 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
361 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.2 
 
 
335 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.34 
 
 
310 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
377 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
381 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
387 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
367 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
367 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
358 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.01 
 
 
350 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.91 
 
 
341 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.91 
 
 
341 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
393 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.91 
 
 
348 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
364 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 
337 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.69 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 
369 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 
348 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
390 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.91 
 
 
348 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.13 
 
 
377 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 
377 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  27.34 
 
 
348 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  25.13 
 
 
377 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
351 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 
381 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.91 
 
 
331 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.99 
 
 
341 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 
377 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.94 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.33 
 
 
378 aa  96.7  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.49 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
325 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  36.88 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  24.36 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.71 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
347 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>