More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1397 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  726    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  59.94 
 
 		 345 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  57.23 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  58.26 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  59.24 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  57.97 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  56.33 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  52.35 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  52.06 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  52.4 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  48.21 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  50.3 
 
 		 328 aa  355  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  51.51 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  45.45 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  46.71 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  44.11 
 
 		 347 aa  289  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  42.69 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  40.8 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  42.15 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  41.38 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  39.18 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  29.02 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  33.23 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  29.62 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  33.13 
 
 		 517 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.72 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.45 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.45 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.87 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  29.15 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.54 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.75 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  41.51 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.18 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  26.47 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  40.88 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  40.88 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.09 
 
 		 310 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  41.45 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  42.76 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  41.45 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  41.45 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  41.45 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  41.45 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 360 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.93 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.71 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.95 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 406 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  42.28 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  41.61 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  41.61 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  41.61 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  41.61 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.11 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.47 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  36.91 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.92 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.06 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.38 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  27.22 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  26.36 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>