More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1079 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  100 
 
 
340 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  45.23 
 
 
342 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  46.71 
 
 
352 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  46.44 
 
 
363 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 
345 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 
345 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  44.11 
 
 
350 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  44 
 
 
341 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  43.08 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  41.82 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  42.47 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  42.59 
 
 
339 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  41.36 
 
 
328 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  42.28 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  40.67 
 
 
337 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  41.77 
 
 
358 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  39.51 
 
 
371 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  38.3 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  38.91 
 
 
370 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 
387 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 
364 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  37.96 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  37.74 
 
 
315 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 
334 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
345 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
343 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
343 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
517 aa  175  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  34.37 
 
 
517 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  35.33 
 
 
330 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
353 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  28.31 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.49 
 
 
318 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
326 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  30.51 
 
 
344 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.18 
 
 
332 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.53 
 
 
317 aa  157  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  31.1 
 
 
335 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 
311 aa  143  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.12 
 
 
312 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
318 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.61 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.56 
 
 
310 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
361 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.6 
 
 
345 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.5 
 
 
332 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.19 
 
 
332 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
321 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
329 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  28.99 
 
 
353 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 
361 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 
360 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.66 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
335 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.48 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.3 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.79 
 
 
356 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
315 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
359 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
327 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
355 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.92 
 
 
329 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.92 
 
 
428 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  30.26 
 
 
334 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
311 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.82 
 
 
319 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.71 
 
 
310 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  30.36 
 
 
328 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  27.05 
 
 
340 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.67 
 
 
334 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  26.61 
 
 
340 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  28.4 
 
 
340 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
326 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.05 
 
 
335 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  29.15 
 
 
316 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 
312 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  26.51 
 
 
313 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  28.88 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  26.44 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.58 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 
322 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  27.3 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.15 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>