More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1859 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  38.17 
 
 
344 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  38.34 
 
 
345 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  37.58 
 
 
334 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 
315 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  36.28 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
517 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  36.67 
 
 
517 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
351 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  32.42 
 
 
350 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.5 
 
 
318 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.41 
 
 
317 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.9 
 
 
335 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.19 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
317 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 
387 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
345 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.91 
 
 
330 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  31.48 
 
 
340 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
345 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 
341 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 
358 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
341 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
341 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
333 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  31.96 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 
364 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
339 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  29.16 
 
 
375 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 
353 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.01 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.41 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.98 
 
 
310 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 
361 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
361 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.76 
 
 
345 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 
311 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
337 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 
312 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.74 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
329 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.89 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  29.91 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  30.07 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
315 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
345 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.52 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 
377 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  28.75 
 
 
340 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 
318 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.99 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  31.06 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  28.44 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.3 
 
 
334 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
334 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
341 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.35 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  27.96 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.62 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.94 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.91 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  29.11 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  29.97 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>