More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2215 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  100 
 
 
344 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  50.68 
 
 
375 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  52.16 
 
 
353 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  52.79 
 
 
343 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  52.49 
 
 
343 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.88 
 
 
350 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
341 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
328 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 
352 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
345 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 
345 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
341 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 
358 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30.51 
 
 
340 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 
387 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 
342 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
364 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 
351 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
363 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
517 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  30.86 
 
 
517 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
315 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
371 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 
337 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
347 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 
317 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.69 
 
 
330 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.15 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.82 
 
 
332 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.12 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.36 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
329 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.07 
 
 
310 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.05 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.23 
 
 
332 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.24 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.44 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.93 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.66 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.07 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.53 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  26.07 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.72 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.62 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  26.79 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  25.11 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  28.7 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  25.52 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.28 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  24.1 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  23.63 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.01 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  25.98 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  22.96 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.09 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  26.09 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  26.09 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  27.24 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  24.7 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  24.47 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>