More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4431 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  94.12 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  70.72 
 
 		 344 aa  472  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  48.17 
 
 		 517 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  48.17 
 
 		 517 aa  309  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  47.88 
 
 		 315 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  43.03 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  39.16 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.8 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  38.78 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  39.48 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.83 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  36.2 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.51 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  37.81 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  38.15 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  38.14 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  34.94 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  37.13 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  34.56 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  37.87 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  33.94 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  35.52 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 342 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 353 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  31.28 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  31.82 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  30.47 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.52 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.25 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.8 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  27.01 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.35 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.39 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.61 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  27.72 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  27.52 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.56 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.8 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  29.67 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 359 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.39 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.63 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  30.04 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.32 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.93 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  26.89 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  26.89 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.85 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  29.69 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  26.45 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.62 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>