More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0307 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
351 aa  714    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  45.97 
 
 
363 aa  285  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 
344 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  43.94 
 
 
334 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  43.79 
 
 
345 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
341 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
341 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  38.58 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
517 aa  225  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  38.19 
 
 
352 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  37 
 
 
345 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  39.46 
 
 
517 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  37.26 
 
 
315 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 
328 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  37.31 
 
 
350 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 
317 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
345 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  39.76 
 
 
345 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 
341 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 
371 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  38.02 
 
 
339 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  39.06 
 
 
330 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 
342 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 
370 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 
358 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.02 
 
 
317 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  36.23 
 
 
347 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
333 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
343 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 
387 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
343 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  36.2 
 
 
364 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 
326 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.19 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  36.79 
 
 
318 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.76 
 
 
332 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  30.47 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  32.36 
 
 
344 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.54 
 
 
335 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.66 
 
 
345 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.27 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.05 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.87 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
331 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.08 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.61 
 
 
332 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.99 
 
 
332 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
344 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
345 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
311 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
329 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  27.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
311 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 
317 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  27.78 
 
 
334 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  27.49 
 
 
334 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  31.31 
 
 
334 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  26.54 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  26.54 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  26.54 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  25.58 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
385 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  32.6 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.5 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  23.8 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.03 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  26.12 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  25.98 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.11 
 
 
310 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.72 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  28.4 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.9 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  26.55 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  26.83 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  25 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 
327 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>