More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1434 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  100 
 
 		 334 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  84.76 
 
 		 331 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  82.37 
 
 		 332 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  83.8 
 
 		 332 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  82.15 
 
 		 345 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  81.6 
 
 		 346 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  79.06 
 
 		 335 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  66.87 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  37.38 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  37.58 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  34.53 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.41 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  34.82 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  36.6 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  36.39 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  34.15 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  32.35 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  33.44 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  34.57 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  33.13 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  31.78 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  30.94 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 360 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  32.06 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.23 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.04 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.79 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  32.26 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  30.48 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.58 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  29.28 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  30.32 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  32.31 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  32.03 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.15 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.25 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.33 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  29.45 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.78 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.47 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.78 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.78 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  30.19 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  30.92 
 
 		 649 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.76 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.27 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  31.23 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.56 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.05 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.74 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.68 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>