More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1913 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 334 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  58.61 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  53.35 
 
 		 333 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.13 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.83 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  52.74 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  53.66 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  53.73 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  46.65 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  40.84 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  40.3 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.7 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.65 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.71 
 
 		 388 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.47 
 
 		 341 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.55 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.55 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.16 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.16 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.79 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 435 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.59 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.92 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.54 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.95 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 357 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.95 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.44 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 385 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.36 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 		 365 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  29.36 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  28.01 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  29.07 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.08 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  28.74 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 		 468 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.13 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.99 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.95 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  29.19 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 667 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.91 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>