More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3862 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  100 
 
 
390 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  68.23 
 
 
393 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  59.49 
 
 
390 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  56.27 
 
 
403 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  58.21 
 
 
390 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  57.44 
 
 
699 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  57.22 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  52.81 
 
 
397 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  54.48 
 
 
396 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  58.85 
 
 
405 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  50.34 
 
 
227 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  31.91 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  26.7 
 
 
455 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.75 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
435 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  37.13 
 
 
495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.4 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
452 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
496 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
470 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
425 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
429 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
467 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
386 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  36.69 
 
 
493 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
421 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
431 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 
385 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  28.73 
 
 
427 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
431 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 
403 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
416 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
427 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  36.36 
 
 
474 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  32.69 
 
 
350 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
351 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
346 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  32.8 
 
 
450 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.16 
 
 
345 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  22.72 
 
 
421 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  22.72 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
416 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
359 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.54 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.31 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.54 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  24.93 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  27.36 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.78 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  27.36 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.77 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.62 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.01 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
715 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  30.7 
 
 
330 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>