More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04142 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 372 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  62.57 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  62.3 
 
 		 367 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  62.57 
 
 		 367 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  62.3 
 
 		 367 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  51.68 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04106  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 325 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  24.91 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  34.39 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  29.17 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  32.18 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.4 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  34 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  25.86 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.4 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.9 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.54 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  32.05 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  29 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.27 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.9 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  27.84 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  27.37 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  25.18 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  25.2 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.18 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  30.27 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.69 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.84 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  34.25 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.77 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.65 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.9 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.22 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  26.24 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>