More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2609 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 331 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  57.06 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  53.82 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.52 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.52 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  54.82 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  51.7 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  49.38 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  47.52 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  42.6 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.95 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.14 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 347 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 432 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.96 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.58 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  27.19 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 369 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.26 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  28.35 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.26 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.26 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.62 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.26 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  31.96 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 355 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.89 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 385 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  27.56 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  29.37 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.84 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  27.56 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  27.82 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  27.82 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.14 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  33.67 
 
 		 386 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  24.93 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.37 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 468 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.59 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.11 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.42 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.96 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.69 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>