More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7086 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
353 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  85.07 
 
 
355 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  56.3 
 
 
345 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  46.7 
 
 
357 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  47.28 
 
 
367 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  46.02 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  46.02 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  44.93 
 
 
353 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  46.47 
 
 
352 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  48.74 
 
 
345 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  45.43 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  44.84 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  45.74 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  45.75 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  44.35 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  44.7 
 
 
372 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  42.36 
 
 
358 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  42.23 
 
 
368 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  41.45 
 
 
352 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  34.26 
 
 
390 aa  235  8e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 
350 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  35.57 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  33.8 
 
 
374 aa  209  8e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.58 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
345 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
347 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.33 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
342 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.21 
 
 
345 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.12 
 
 
331 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
344 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
331 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
377 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
311 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
353 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.52 
 
 
332 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
350 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
359 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.79 
 
 
332 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
359 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.27 
 
 
370 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
352 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.25 
 
 
312 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 
335 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
359 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
334 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
331 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
337 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
355 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.66 
 
 
363 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  28.69 
 
 
353 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
344 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
359 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 
360 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
358 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
358 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
337 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
357 aa  99.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 
328 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.86 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.75 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  29.25 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.86 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.3 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.85 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.25 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.08 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.11 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
388 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.9 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  33.92 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
355 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
345 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
339 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>