More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4750 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  46.08 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  38.49 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  36.83 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  30.55 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 387 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.24 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.97 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 		 412 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.84 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.67 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  35.17 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  32.91 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.48 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  35.16 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.21 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.45 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.41 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.91 
 
 		 404 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  30.29 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.71 
 
 		 428 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.71 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.61 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 400 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.21 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  31.33 
 
 		 399 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30.69 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  30.69 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30.69 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  25.96 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>