More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78306 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  100 
 
 
390 aa  813    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  53.99 
 
 
374 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  40.36 
 
 
398 aa  273  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
353 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
355 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  35.07 
 
 
350 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  34.79 
 
 
350 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
350 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
354 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  33.79 
 
 
357 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.59 
 
 
352 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 
358 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.6 
 
 
347 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  33.61 
 
 
345 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
355 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  31.11 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
352 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.67 
 
 
363 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
377 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
359 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
328 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
358 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
356 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  21.52 
 
 
370 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.81 
 
 
331 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
324 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
334 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  25.63 
 
 
324 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
324 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
387 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.2 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.86 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
339 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.03 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.32 
 
 
346 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  22.02 
 
 
352 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.28 
 
 
337 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
350 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
359 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  22.71 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
326 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 
333 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
341 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.18 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  21.08 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.28 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.32 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.04 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  24.14 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  24.07 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.25 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.8 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  23.68 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.46 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  25.07 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  24.59 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  24.27 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>