More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1579 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 333 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  30.12 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  29.17 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  29.9 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  29.8 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  27.08 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  26.2 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  31.23 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  25.8 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  25.5 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.89 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  22.32 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  20.92 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.51 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  26.87 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  26.27 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.38 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  21.11 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.37 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.79 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  24.12 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  25.42 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  23.22 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.03 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.03 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  25.61 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  23.86 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.56 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.02 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  28.79 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  27.49 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  29.15 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  23.23 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  22.57 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  22.48 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  25.73 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  25.5 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  23.26 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  26.3 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.84 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  28.28 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  23.25 
 
 		 372 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.28 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  28.28 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  23.29 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  20.75 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 429 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.79 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  26.97 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.37 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 		 353 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.55 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  24.17 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  22.85 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>