More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3468 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
345 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  56.3 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  57.18 
 
 
355 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  45.03 
 
 
357 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  47.34 
 
 
353 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  45.06 
 
 
354 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  44.71 
 
 
345 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  42.9 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  45.13 
 
 
368 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  42.01 
 
 
350 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  42.6 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  44.35 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  44.05 
 
 
352 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  41.33 
 
 
352 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  41.42 
 
 
347 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  40.46 
 
 
358 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  37.33 
 
 
390 aa  236  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  35.76 
 
 
350 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  37.43 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  34.31 
 
 
398 aa  200  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
345 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.29 
 
 
331 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
347 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.49 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.29 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
356 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
353 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.08 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
344 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
359 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.75 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
333 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
338 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
335 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 
342 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  28.53 
 
 
335 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
311 aa  106  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
366 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
344 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.82 
 
 
345 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
356 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
366 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 
359 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.91 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.15 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  25.78 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.02 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 
344 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
319 aa  92.8  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 
355 aa  92.4  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
330 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
366 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
366 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  24.35 
 
 
353 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  28.38 
 
 
349 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.59 
 
 
328 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.89 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  25.78 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.3 
 
 
353 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 
344 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  24.85 
 
 
332 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.94 
 
 
331 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  25.22 
 
 
404 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
359 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>