More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1244 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  100 
 
 		 349 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1513  oxidoreductase domain-containing protein  39.24 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  38.07 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.7 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 		 342 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  26.74 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.98 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  25.98 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  31.37 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  25.46 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.48 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.48 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  23.16 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.76 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.24 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.48 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.48 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.48 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.63 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.63 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.43 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.89 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2532  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.53 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.57 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.18 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  26.52 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>