More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2267 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 330 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  35.24 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 361 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  34.93 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  33.65 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  33.65 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.71 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.47 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 366 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  33.65 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  33.65 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  33.65 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  33.65 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.36 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 371 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.93 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.35 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 359 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  29.03 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  29.03 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  26.61 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.73 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  28.34 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  29.24 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 1079 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 1080 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1950  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.68 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  24.61 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.16 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 699 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  30.09 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.62 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  20.86 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  21.02 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.95 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.16 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.58 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  21.39 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.7 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.98 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>