More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2206 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
316 aa  617  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  47 
 
 
1080 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  46.37 
 
 
1079 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  49.67 
 
 
323 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  41.72 
 
 
324 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  41.72 
 
 
324 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  41.72 
 
 
324 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  44.67 
 
 
323 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 
368 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
344 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.09 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
329 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
345 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.04 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.75 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  23.41 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.86 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  29.75 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  27.43 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.47 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.76 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.92 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  23.76 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  36.54 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  29.52 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  25.58 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.72 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  28.93 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.79 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.17 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.87 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.94 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  21.22 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.04 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  20 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.69 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  33.67 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  21.35 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.53 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.92 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.8 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>