More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5611 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  68.46 
 
 
1080 aa  1494    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1079 aa  2176    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51 
 
 
367 aa  333  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  48.98 
 
 
364 aa  265  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 
364 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 
364 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  46.18 
 
 
316 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  45.2 
 
 
323 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  40.06 
 
 
324 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  40.06 
 
 
324 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  40.06 
 
 
324 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  36.75 
 
 
354 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  41.12 
 
 
323 aa  202  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
372 aa  160  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
357 aa  153  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
382 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.1 
 
 
371 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
364 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 
344 aa  115  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
371 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
439 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
381 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
373 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.91 
 
 
419 aa  106  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
379 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
353 aa  105  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
389 aa  103  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
394 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
385 aa  102  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
376 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
440 aa  101  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
383 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
371 aa  100  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
342 aa  99.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
377 aa  99.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
395 aa  99.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
356 aa  99.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.64 
 
 
745 aa  99.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 
389 aa  99  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
394 aa  99.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
359 aa  99  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
394 aa  98.6  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
384 aa  97.8  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
378 aa  97.8  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
387 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 
413 aa  97.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.32 
 
 
365 aa  97.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
386 aa  97.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
409 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.12 
 
 
343 aa  97.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
368 aa  96.3  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.34 
 
 
370 aa  95.9  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
366 aa  95.1  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  32.96 
 
 
369 aa  95.1  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.74 
 
 
365 aa  95.1  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
371 aa  94  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
399 aa  94  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
360 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
398 aa  93.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
382 aa  92.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
388 aa  92  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
383 aa  92  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.78 
 
 
369 aa  92  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.15 
 
 
338 aa  92  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
398 aa  91.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
401 aa  91.3  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
382 aa  91.3  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
361 aa  90.5  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
387 aa  90.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30 
 
 
379 aa  91.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
337 aa  91.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
369 aa  90.9  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
398 aa  90.1  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
378 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
360 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
389 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
414 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
380 aa  90.1  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
391 aa  90.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
387 aa  90.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
385 aa  90.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
374 aa  89.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
381 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
453 aa  88.6  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
383 aa  88.2  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
384 aa  88.2  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  25.78 
 
 
353 aa  87.8  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  33.13 
 
 
374 aa  88.2  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
362 aa  87.4  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 
345 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
371 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
394 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
381 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
358 aa  86.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
378 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
374 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
377 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.28 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>