More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2847 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  100 
 
 
345 aa  707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  39.53 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
337 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  25.97 
 
 
326 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
326 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  27.08 
 
 
333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.28 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.64 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  21.07 
 
 
348 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
335 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
353 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.48 
 
 
347 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  22.33 
 
 
340 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  26.49 
 
 
300 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
345 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 
354 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  21.71 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  24.18 
 
 
352 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
350 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
387 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.07 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
355 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  26.51 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  24.9 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  21.88 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.36 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
329 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
312 aa  87  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
347 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  23.63 
 
 
352 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  24.51 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  23.37 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  24.73 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
517 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  25.84 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.2 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  24.51 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  23.68 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.91 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.46 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  23.22 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.18 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  22.19 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  24.65 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  20.27 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  21.68 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  22.38 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  22.13 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  21.7 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  20.85 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.05 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  26.33 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  25.84 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.97 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  23.14 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  25.5 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.8 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  25.77 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  25.77 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  26.54 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.29 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>