More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4096 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 354 aa  710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  57.35 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  56.4 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  57.06 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  57.39 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  52.74 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  45.06 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  45.22 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  45.48 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  44.35 
 
 		 353 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  42.07 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  42.69 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  42.69 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  43.73 
 
 		 350 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  42.36 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  42.57 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  43.4 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  44.41 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  42 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  41.81 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  34.71 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  32.12 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  33.89 
 
 		 374 aa  175  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 412 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.17 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  34.48 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.95 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.79 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.57 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.22 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.92 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.09 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.19 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.24 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.82 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  20.79 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  21.61 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.89 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  22.78 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.68 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.16 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.35 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  23.86 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>