More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3495 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  82.32 
 
 		 328 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  79.57 
 
 		 328 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  78.96 
 
 		 328 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  69.51 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  63.08 
 
 		 342 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  62.19 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  62.19 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  47.48 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  45.9 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  43.93 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  42.07 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  42.15 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  40.3 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  40.18 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  39.25 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  37.3 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  38.72 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  38.31 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 667 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.2 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  32.02 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.6 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.49 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  33.77 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.31 
 
 		 370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  30.15 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  32.75 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 665 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  29.55 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  29.67 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.82 
 
 		 670 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  29.82 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  29.67 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  29.55 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  32.46 
 
 		 451 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.64 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.87 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.42 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  29.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.12 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 667 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  28.87 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  28.87 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  28.87 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 435 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.6 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  28.87 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  29.55 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 667 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 468 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 667 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 385 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  30.77 
 
 		 369 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  31.75 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 435 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  38.33 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.25 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>