More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2113 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
344 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  47.77 
 
 
342 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.8 
 
 
343 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.89 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
366 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
345 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 
359 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  28.96 
 
 
342 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.73 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
383 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.59 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.67 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.28 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  24.69 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  24.69 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  27.68 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.91 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  24.57 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.82 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.38 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.14 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  22.56 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  26.48 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  23.08 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.43 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.8 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.39 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.43 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
435 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>