More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4438 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  74.31 
 
 		 396 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 401 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  83.04 
 
 		 397 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  58.75 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  58.75 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  56.03 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  41.93 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  28.86 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  27.72 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 366 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.33 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.33 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.27 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.3 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.53 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  26.43 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  22.73 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 377 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  24.94 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  26.19 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.3 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.16 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.19 
 
 		 335 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.16 
 
 		 341 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.59 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.59 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.16 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  25.57 
 
 		 335 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 334 aa  93.2  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  23.16 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.59 
 
 		 287 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.49 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 667 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0643  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  25.43 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  24.66 
 
 		 359 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  21.88 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  25.86 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  25.9 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  25.17 
 
 		 338 aa  86.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.11 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.15 
 
 		 329 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.19 
 
 		 331 aa  86.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>