More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0261 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  100 
 
 
414 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  83.7 
 
 
414 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  65.01 
 
 
414 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  67.25 
 
 
414 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  53.33 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  45.61 
 
 
415 aa  345  8.999999999999999e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0643  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
404 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  32.98 
 
 
347 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
396 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
397 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
401 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
399 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.63 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.72 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  23.54 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.76 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  23.22 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  26.6 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.52 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  28.04 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  21.98 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.59 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.7 
 
 
343 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.7 
 
 
343 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1022  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.64 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
333 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
339 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 
331 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.29 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.29 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.29 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
347 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.27 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.29 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.29 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.89 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.67 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
325 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  27.64 
 
 
337 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.12 
 
 
332 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  25 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.89 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.98 
 
 
388 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.81 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.81 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  32.55 
 
 
333 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  24.75 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
328 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  23.12 
 
 
335 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 
342 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  28.05 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
326 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.36 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  24.91 
 
 
336 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  29.63 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.63 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.98 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.98 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.63 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  25.24 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>