More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1022 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1022  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
393 aa  822    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 
402 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 
393 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  25.06 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  40.21 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
355 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  23.68 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  20.92 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.86 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  21.99 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  22.08 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  22.37 
 
 
358 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
353 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
325 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.81 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  36.46 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  38.14 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 
347 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.19 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.44 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.69 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  22.77 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
694 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
320 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  28.42 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  32.98 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  22.59 
 
 
387 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  22.89 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.79 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 
343 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  33 
 
 
381 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 
387 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
429 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  38.3 
 
 
330 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  37.37 
 
 
399 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37 
 
 
343 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  22.07 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.79 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  21.59 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  23.67 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.63 
 
 
312 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
364 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.19 
 
 
337 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
330 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>