More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0315 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 694 aa  1394    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 352 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 345 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.7 
 
 		 357 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  40.4 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  27.63 
 
 		 695 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 		 375 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 		 375 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 379 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  38.41 
 
 		 377 aa  94.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 		 342 aa  94  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  36.18 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 		 371 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  36.68 
 
 		 387 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 370 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  33.55 
 
 		 331 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 370 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 344 aa  90.5  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  38.56 
 
 		 358 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  36.14 
 
 		 375 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 		 335 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 		 366 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  38.52 
 
 		 342 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  37.68 
 
 		 331 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  34.87 
 
 		 330 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 363 aa  87.8  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.69 
 
 		 312 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  36.81 
 
 		 358 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 358 aa  87.4  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 330 aa  87.4  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.43 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  32.32 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.54 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  33.99 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  37.25 
 
 		 337 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  38.57 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.43 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  36.13 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  36.5 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  40.14 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.14 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 339 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.11 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  35.77 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 746 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  34.36 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  33.12 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  38.67 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.8 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  41.26 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.35 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  34.8 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  30.77 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  35 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.12 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.28 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  30.21 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 350 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  35.53 
 
 		 335 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.38 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  31.45 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  32.51 
 
 		 336 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 333 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  35.33 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  36.69 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  36.61 
 
 		 314 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.02 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>