More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5287 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
350 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
359 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
359 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2948  Male sterility domain protein  31.72 
 
 
359 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0517571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 
680 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.84 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.84 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.53 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.53 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.53 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
510 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
334 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.93 
 
 
375 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.4 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.16 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.58 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.62 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 
694 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  33.71 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  24.93 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
746 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.43 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  27.8 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.33 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.41 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.56 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  26.57 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  29.44 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  26.71 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  26.86 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  27.62 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>