More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1920 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
346 aa  716    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.37 
 
 
347 aa  554  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.65 
 
 
347 aa  557  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.55 
 
 
349 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.9 
 
 
347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.99 
 
 
348 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 
349 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.49 
 
 
363 aa  348  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.51 
 
 
348 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
335 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  28.26 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  30.68 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
335 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
333 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
323 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
328 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
353 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
309 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
334 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
332 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
328 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 
334 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.46 
 
 
327 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
310 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
312 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
328 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.91 
 
 
330 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.76 
 
 
336 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
313 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
326 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28 
 
 
366 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.14 
 
 
335 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.55 
 
 
331 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.94 
 
 
328 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.84 
 
 
363 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
309 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
334 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.81 
 
 
330 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
328 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
310 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
333 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
358 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  26.38 
 
 
328 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
298 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
328 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.15 
 
 
312 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 
371 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.65 
 
 
338 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 
371 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
299 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
352 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
355 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
329 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.86 
 
 
375 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.87 
 
 
371 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.46 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.73 
 
 
308 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.78 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
308 aa  99.4  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.46 
 
 
328 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.23 
 
 
335 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
323 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.16 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.16 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.73 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.16 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
292 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  28.77 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.64 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.3 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  26.27 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.82 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.7 
 
 
340 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.2 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  27.73 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
314 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
310 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.04 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.18 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.33 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>