More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0852 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  100 
 
 
336 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.29 
 
 
335 aa  627  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
347 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
348 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
347 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
349 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
349 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
363 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
348 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.13 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.07 
 
 
357 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  26.72 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.71 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  26.57 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.26 
 
 
322 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.53 
 
 
323 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  27.01 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.36 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
317 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.48 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  25.71 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  24.17 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.24 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  26.74 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.61 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  26.69 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.13 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.98 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.13 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  27.02 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  26.69 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  26.69 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.78 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.02 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.69 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.17 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  23.93 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.99 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  25.79 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.07 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.46 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  24.48 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0710  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.21 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.49 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.96 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  33.55 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  27.7 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.86 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.96 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  26.92 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.53 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  27.76 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.88 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.61 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.64 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.76 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>