More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1168 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
353 aa  713    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  39.51 
 
 
331 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  39.51 
 
 
331 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 
331 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  39.51 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 
319 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.215962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
330 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 
328 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.10173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 
318 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  36.47 
 
 
329 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
349 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
346 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
315 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
306 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
348 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
312 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
333 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
349 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
347 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
318 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  28.2 
 
 
328 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.89 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  31.23 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
680 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0220  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.7 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.17 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  24.4 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  40.12 
 
 
330 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
335 aa  92.8  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
361 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  39.51 
 
 
330 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
328 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  28.14 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.28 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
297 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.41 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  30.41 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.41 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.41 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.41 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  34.2 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
314 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
308 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.12 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  38.04 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.12 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  28.12 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.87 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104829  normal  0.0341268 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.92 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.92 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.81 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>