More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1984 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 318 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.41 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.32 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.71 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  57.28 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.68 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.71 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.33 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  57.59 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 		 322 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  56.19 
 
 		 326 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.21 
 
 		 322 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.78 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.5 
 
 		 508 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.02 
 
 		 319 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  55.87 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 323 aa  322  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  50.94 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.78 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.77 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.88 
 
 		 506 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.47 
 
 		 309 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.48 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  49.04 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  51.15 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.7 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.92 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.26 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.4 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.22 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  48.38 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.65 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  42.04 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  41.4 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.84 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.26 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  45.43 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.79 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  42.41 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.41 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.41 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.41 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.41 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.68 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.68 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.53 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  40.38 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  34.78 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  37.02 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  36.64 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.63 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  27.96 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  27.54 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  27.54 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.2 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.2 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.41 
 
 		 371 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  29.63 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.213871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>