More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2167 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
349 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
321 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
318 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
321 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  30.5 
 
 
318 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
315 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
321 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  32.71 
 
 
324 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  30.18 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
313 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  31.27 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
320 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  31.38 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
317 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
320 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  33.2 
 
 
326 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
320 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
320 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.41 
 
 
508 aa  126  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
293 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  32.41 
 
 
323 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
309 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  30.41 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  31.48 
 
 
309 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  30.86 
 
 
321 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  28.48 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  31.37 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  29.58 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.55 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
309 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
307 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
353 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.85 
 
 
320 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
506 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
333 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
331 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
336 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
351 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
318 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
311 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.92 
 
 
330 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.83 
 
 
375 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
326 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
310 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
331 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  26.55 
 
 
370 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.25 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.25 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.25 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
326 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
339 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.39 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.92 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
370 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  23.71 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  23.71 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>