More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2309 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 307 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.35 
 
 		 307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.51 
 
 		 307 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.4 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.08 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.68 
 
 		 313 aa  344  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  37.62 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.27 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.72 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  37.54 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.07 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.07 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.07 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.07 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  41.75 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.75 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.75 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  39.47 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  39.87 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  38.54 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  31.82 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  31.49 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.73 
 
 		 508 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  34.42 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.5 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  37.54 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  37.97 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 506 aa  155  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  35.37 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  33.01 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  31.7 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  30.16 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  35.86 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  36.64 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  27.85 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31.3 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  33.33 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.06 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  28.73 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.51 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  34.63 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>