More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1481 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  100 
 
 		 332 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  82.19 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  82.19 
 
 		 321 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.89 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.89 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.03 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.34 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.26 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.92 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  60.76 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.75 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.56 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.5 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  45.74 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  39.62 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.27 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 		 317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.8 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.44 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.74 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  35.22 
 
 		 318 aa  222  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  45.54 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  34.59 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.28 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  41.43 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  40.32 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  41.59 
 
 		 326 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.83 
 
 		 508 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 506 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  36.98 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  31.41 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  37.33 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.19 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  37.2 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 285 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  30.38 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  33.14 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.14 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  25.37 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>