More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0811 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 313 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.74 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.9 
 
 		 320 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  53.31 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.35 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.12 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.88 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  55.15 
 
 		 508 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  52.92 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  53.53 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 		 315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  48.74 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  49.83 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  48.23 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.37 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.56 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  49.84 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.1 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.76 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.57 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.95 
 
 		 506 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.63 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  41.85 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  40.19 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  40.2 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  39.03 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  39.75 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.43 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  38.71 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  34.01 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  34.27 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  35.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  28.75 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  28.75 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  28.75 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.63 
 
 		 357 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  33.05 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  26.64 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>