More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
357 aa  694    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
323 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  59.88 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.19 
 
 
330 aa  325  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.99 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.5 
 
 
329 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.36 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.94 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.87 
 
 
330 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.3 
 
 
339 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2007  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.29 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.35 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2272  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.61 
 
 
337 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.04 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  34.23 
 
 
365 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.43 
 
 
357 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.32 
 
 
350 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.63 
 
 
376 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  36.53 
 
 
351 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.93 
 
 
349 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.28 
 
 
330 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.97 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.43 
 
 
361 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.48 
 
 
400 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2733  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.52 
 
 
380 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.652066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  32.26 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.93 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.63 
 
 
332 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.94 
 
 
375 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.14 
 
 
375 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.43 
 
 
394 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  39.22 
 
 
336 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1448  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.16 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.45 
 
 
329 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.35 
 
 
402 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2797  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.15 
 
 
402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.872039  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.37 
 
 
399 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1583  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.37 
 
 
399 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  35.52 
 
 
680 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
318 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.11 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.11 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.27 
 
 
328 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.5 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  30.64 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.27 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.27 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.34 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.76 
 
 
375 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
331 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
329 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
326 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387082  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  27.46 
 
 
330 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  27.03 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  27.63 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1049  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.92 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0999  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.64 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0932  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.64 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0967  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.64 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.64 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.9 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.9 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.9 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.88 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1660  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375362  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
333 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.56 
 
 
364 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00873  predicted NAD(P)H-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.48 
 
 
337 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0332928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.48 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00879  hypothetical protein  29.48 
 
 
337 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0435323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.48 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1028  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.48 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.779011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
349 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2464  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.19 
 
 
349 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.954565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0896  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.48 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
336 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
321 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2622  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.03 
 
 
335 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1586  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.03 
 
 
335 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
335 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.319436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
318 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
334 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4360  dehydrogenase, putative  26.89 
 
 
306 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48864  reductase with NAD or NADP as acceptor  27.42 
 
 
395 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.58602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
318 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>