More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1553 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1448  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  81.84 
 
 
375 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  95.52 
 
 
399 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1583  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  96.27 
 
 
399 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2797  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  97.51 
 
 
402 aa  793    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.872039  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 
402 aa  831    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  76.73 
 
 
394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  76.86 
 
 
387 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  76.21 
 
 
375 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  75.96 
 
 
375 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  60.46 
 
 
361 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  60.87 
 
 
400 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  62.08 
 
 
349 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2733  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  60.24 
 
 
380 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.652066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  58.84 
 
 
365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  60.71 
 
 
376 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  61.56 
 
 
373 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.3 
 
 
357 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  56.01 
 
 
351 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.9 
 
 
330 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.63 
 
 
330 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.31 
 
 
331 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.11 
 
 
330 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.71 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2007  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.71 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2272  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.32 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.4 
 
 
330 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.85 
 
 
332 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.58 
 
 
332 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  42.2 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.42 
 
 
350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.48 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.25 
 
 
329 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
326 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.44 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
344 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.29 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.89 
 
 
366 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.16 
 
 
330 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.47 
 
 
328 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.47 
 
 
328 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.32 
 
 
375 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.47 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.47 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0220  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.53 
 
 
338 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  27.72 
 
 
326 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.89 
 
 
357 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.03 
 
 
329 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  26.87 
 
 
370 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4699  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.26 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
371 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
371 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  26.65 
 
 
329 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  26.04 
 
 
330 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
330 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  26.65 
 
 
329 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71224  Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating  27.91 
 
 
349 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
342 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.46 
 
 
364 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87094  predicted protein  27.32 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.06869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  27.05 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4360  dehydrogenase, putative  27.02 
 
 
306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
342 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
338 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271761 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48864  reductase with NAD or NADP as acceptor  25.85 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.58602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
333 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
331 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
330 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387082  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
330 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
351 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
312 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0661585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
328 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
334 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.79 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
330 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  26.52 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1660  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
336 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375362  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
680 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.33 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1028  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.33 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.779011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
320 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0896  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.33 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 
349 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.67 
 
 
349 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 
349 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00873  predicted NAD(P)H-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  23.67 
 
 
337 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0332928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>