More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2868 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  693    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391729  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.05 
 
 
338 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  68.05 
 
 
338 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.75 
 
 
338 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.76 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.55 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1660  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.22 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375362  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2622  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.11 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.319436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1586  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.11 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1028  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  45.54 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.779011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.54 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00873  predicted NAD(P)H-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  45.54 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0332928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0896  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.54 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00879  hypothetical protein  45.54 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0435323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.54 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2464  NAD dependent epimerase/dehydratase family  45.24 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.954565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0999  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.35 
 
 
337 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1049  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.35 
 
 
337 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0932  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.05 
 
 
337 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.05 
 
 
337 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0967  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.05 
 
 
337 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.45 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  37.65 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  37.35 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  37.35 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  37.35 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  37.35 
 
 
328 aa  212  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  37.95 
 
 
326 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
328 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  37.57 
 
 
328 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  37.31 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
332 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  36.61 
 
 
329 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
333 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
326 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
330 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  34.23 
 
 
330 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
330 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387082  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  34.14 
 
 
351 aa  142  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.75 
 
 
357 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
329 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4360  dehydrogenase, putative  33.55 
 
 
306 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.02 
 
 
349 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  32.43 
 
 
387 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.16 
 
 
339 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.14 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.97 
 
 
361 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.72 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.11 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.94 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.73 
 
 
330 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.49 
 
 
376 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.34 
 
 
375 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.83 
 
 
394 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2733  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.57 
 
 
380 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.652066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2007  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
331 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0661585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.82 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  29.71 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.23 
 
 
330 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1448  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.65 
 
 
375 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.82 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2272  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.81 
 
 
337 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1583  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.07 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.84 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2797  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.84 
 
 
402 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.872039  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2950  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
303 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.79 
 
 
399 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
351 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.86 
 
 
332 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.41 
 
 
332 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
333 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.93 
 
 
329 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.77 
 
 
330 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9273  putative oxidoreductase  31.46 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.2 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2502  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.25 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.25 
 
 
320 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.86 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.63 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0220  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.07 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4699  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.33 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.27 
 
 
371 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
339 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>