More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1276 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
313 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.38 
 
 
315 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.39 
 
 
315 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.46 
 
 
320 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.12 
 
 
319 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.73 
 
 
322 aa  350  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.52 
 
 
321 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.55 
 
 
322 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 
318 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  58.39 
 
 
317 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.23 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  57.84 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.77 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.65 
 
 
320 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.75 
 
 
508 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  54.9 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.61 
 
 
320 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.43 
 
 
320 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  54.1 
 
 
306 aa  315  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  51.31 
 
 
323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  51.44 
 
 
321 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 
341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.98 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  51.96 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  53.59 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  52.96 
 
 
326 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
309 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.57 
 
 
506 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.24 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 
293 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.15 
 
 
338 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 
328 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 
314 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 
324 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
321 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.6 
 
 
318 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
318 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
318 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  40.78 
 
 
318 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.23 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.58 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  42.58 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.58 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.58 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.58 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.26 
 
 
321 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  38.83 
 
 
318 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.26 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
321 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
307 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
320 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  42.44 
 
 
332 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
320 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
321 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
321 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
321 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  37.83 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
321 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  30.87 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
307 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
307 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
307 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
285 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
310 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  35.03 
 
 
289 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
305 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
349 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  34.58 
 
 
290 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
321 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
313 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
285 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  29.35 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
346 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
325 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
287 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.31 
 
 
330 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
331 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
370 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.89 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  25.3 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  28.36 
 
 
351 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  25 
 
 
331 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  25 
 
 
331 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
331 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  28.86 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.41 
 
 
364 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>