More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0197 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 370 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.65 
 
 		 370 aa  732    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.19 
 
 		 388 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.73 
 
 		 370 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.86 
 
 		 370 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.73 
 
 		 372 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.58 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.19 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.14 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.91 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.49 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.36 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.9 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.18 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.57 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.16 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.18 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.53 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  57.26 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.53 
 
 		 372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.86 
 
 		 377 aa  317  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.65 
 
 		 379 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  43.85 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.97 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 375 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  36.46 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.72 
 
 		 343 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  36.19 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  39.04 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  35.73 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.17 
 
 		 309 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 310 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.56 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  38.08 
 
 		 287 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 		 327 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.94 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.66 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 343 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  33.24 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.39 
 
 		 330 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.15 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.66 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.42 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 312 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>