More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0708 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
343 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.54 
 
 
373 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.47 
 
 
352 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.15 
 
 
347 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.9 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.19 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  51.13 
 
 
346 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.56 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.27 
 
 
343 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.27 
 
 
343 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 
348 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
372 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.55 
 
 
370 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 
388 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
370 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.72 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
370 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 
373 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
372 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
382 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
368 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
372 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
379 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
379 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
369 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 
368 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.01 
 
 
372 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.23 
 
 
391 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 
368 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
378 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
373 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
368 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  36.52 
 
 
368 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32 
 
 
298 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
375 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
377 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
364 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
292 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
325 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
292 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
321 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
313 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
314 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
317 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.44 
 
 
363 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
311 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
333 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.3 
 
 
318 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
308 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
310 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
322 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
302 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.35 
 
 
307 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
354 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
356 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
328 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
356 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
356 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
356 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
363 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  28.33 
 
 
363 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.33 
 
 
364 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  33.42 
 
 
331 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
312 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
309 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  26.12 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
312 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
306 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
316 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
309 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
327 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.29 
 
 
309 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
309 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  34.06 
 
 
320 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
313 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
340 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  31.1 
 
 
330 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  25.62 
 
 
328 aa  116  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5374  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:nucleotide sugar epimerase  30.69 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>